Иерархическая навигация предоставляет возможность найти необходимый анатомический элемент, переходя к нему по цепочке содержащих его элементов от более крупных к более мелким. Элемент управления с деревом, представляющим этот режим навигации, присутствует в приложении постоянно. Это отличает его от других режимов, таких как пространственная навигация или структурная навигация. Если элемент управления с деревом не активен в текущий момент, перейти к нему можно путём нажатия клавиши табуляции (Tab).
Верхний уровень дерева содержит категории понятий. Среди них центральную роль играет раздел "Тело человека", только для его элементов доступна пространственная и структурная навигация. Прочие разделы, такие как "Клетки", "Гормоны" и пр. содержат только информационые страницы с текстовыми описаниями понятий.
Основная навигация по дереву осуществляется клавишами стрелок вверх-вниз. При перемещении произносится название элемента и его статус: свёрнут или развёрнут. Для удобства и для повышения интуитивного восприятия тип элемента можно установить по звуку, которым снабжается уведомление. Если элемент может быть развёрнут или свёрнут, то переключение его состояния выполняется путём нажатия клавиши Enter или путём нажатия клавиш влево-вправо: стрелка вправо разворачивает элемент, стрелка влево — сворачивает.
Если в дереве выбран анатомический элемент, то с ним могут быть доступны следующие операции: