Пространственная навигация — это основная функция учебного пособия. Она предназначена для получения учащимся представления о взаимном расположении органов и их частей. Работа с этим режимом подразумевает выполнение учащимся большого количества попыток перемещения в воображаемом пространстве внутри тела человека. После каждого шага программа уведомляет о результате перемещения — удалось ли выполнить перемещение, и какой орган или его часть наиболее точно соответствует новой точке.
Перемещения можно выполнять в трёх измерениях. Некоторые органы при общем обзоре воспринимаются как единое целое с дополнительной возможностью перейти к изучению его составных частей. При переходе к изучению составных частей доступное пространство ограничивается пространством выбранного органа.
Пространственная навигация не сохраняет представление о физических габаритах органов, сообщая сведения только о взаимном расположении органов между собой. Таким образом, например, попытка совершения одного шага по вертикали вдоль пищевода и вдоль фаланги пальца будет приводить к перемещению на разное расстояние в пространстве.
Поскольку приложение позволяет выполнять перемещения в трёхмерном воображаемом пространстве, предусмотрено наличие двух режимов: вид спереди и вид сбоку. Переключение между режимами происходит нажатием клавиши пробел. После каждой попытки перемещения в заданном направлении, произносится новое анатомическое понятие, к которому произведено перемещение с одним из трёх возможных сигналов:
Невозможность произвести перемещение означает, что текущим является элемент около границы текущей обозреваемой области. Если сигнал уведомил, что новый обозреваемый элемент является составным, то можно перейти к исследованию его составных частей путём нажатия клавиши Enter. Завершить исследование составных элементов можно путём нажатия клавиши Escape.
Перемещения выполняются путём нажатия клавиш-стрелок на клавиатуре в соответствии с желаемым направлении. Движение вверх-вниз всегда обрабатывается как движение по-вертикали. При этом движение вправо-влево обрабатывается различным способом в зависимости от текущего режима: оно может подразумевать как движение вправо влево, так и движение ближе к спине или ближе к лицу или передней стенке туловища.
Версия программы для GNU/Linux при запуске производит попытку открытия устройства /dev/input/mice.
Если устройство существует, и его права доступа позволяют чтение данных из него,
то приложение будет интерпретировать действия на touch pad так же,
как оно интерпретирует нажатия клавиш-стрелок.
Использование touch-pad позволяет получить более интуитивное представление о взаимном расположении органов,
чем при использовании клавиш-стрелок.
Для текущего элемента можно выполнить некоторые операции: